Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Otx1P80205 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx1P80205 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx1P80205 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx1P80205 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx1P80205 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx1P80205 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx1P80205 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Otx1P80205 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Otx1P80205 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms