Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rad54lP70270 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad54lP70270 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms