Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NficP70255 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NficP70255 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NficP70255 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NficP70255 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NficP70255 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NficP70255 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NficP70255 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NficP70255 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NficP70255 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NficP70255 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NficP70255 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
NficP70255 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NficP70255 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NficP70255 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
NficP70255 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NficP70255 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NficP70255 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NficP70255 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NficP70255 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NficP70255 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NficP70255 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NficP70255 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NficP70255 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NficP70255 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NficP70255 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NficP70255 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NficP70255 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NficP70255 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NficP70255 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NficP70255 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NficP70255 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NficP70255 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NficP70255 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NficP70255 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NficP70255 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NficP70255 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NficP70255 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NficP70255 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NficP70255 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NficP70255 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NficP70255 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NficP70255 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NficP70255 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NficP70255 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NficP70255 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NficP70255 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NficP70255 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NficP70255 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NficP70255 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NficP70255 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NficP70255 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NficP70255 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NficP70255 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NficP70255 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NficP70255 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NficP70255 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NficP70255 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NficP70255 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NficP70255 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NficP70255 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NficP70255 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NficP70255 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NficP70255 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NficP70255 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NficP70255 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NficP70255 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NficP70255 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NficP70255 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NficP70255 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NficP70255 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NficP70255 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NficP70255 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NficP70255 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NficP70255 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NficP70255 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NficP70255 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NficP70255 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NficP70255 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NficP70255 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NficP70255 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NficP70255 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NficP70255 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NficP70255 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NficP70255 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NficP70255 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NficP70255 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NficP70255 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NficP70255 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NficP70255 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NficP70255 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NficP70255 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NficP70255 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NficP70255 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NficP70255 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NficP70255 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NficP70255 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NficP70255 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NficP70255 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NficP70255 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms