Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd13P70217 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms