Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubb4bP68372 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb4bP68372 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms