Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Acta1P68134 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Acta1P68134 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Acta1P68134 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Acta1P68134 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Acta1P68134 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Acta1P68134 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Acta1P68134 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Acta1P68134 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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