Protein–RNA interactions for Protein: P62892

Rpl39, 60S ribosomal protein L39, mousemouse

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Length 51 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39P62892 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl39P62892 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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