Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SnrpfP62307 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpfP62307 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms