Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ActbP60710 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ActbP60710 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ActbP60710 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ActbP60710 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ActbP60710 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ActbP60710 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ActbP60710 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ActbP60710 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ActbP60710 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ActbP60710 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ActbP60710 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ActbP60710 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ActbP60710 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ActbP60710 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ActbP60710 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ActbP60710 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ActbP60710 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ActbP60710 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ActbP60710 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ActbP60710 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ActbP60710 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ActbP60710 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ActbP60710 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ActbP60710 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ActbP60710 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ActbP60710 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ActbP60710 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ActbP60710 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ActbP60710 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ActbP60710 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ActbP60710 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ActbP60710 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ActbP60710 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ActbP60710 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ActbP60710 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ActbP60710 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ActbP60710 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ActbP60710 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ActbP60710 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ActbP60710 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ActbP60710 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ActbP60710 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ActbP60710 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ActbP60710 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ActbP60710 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ActbP60710 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ActbP60710 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ActbP60710 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ActbP60710 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ActbP60710 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ActbP60710 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ActbP60710 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ActbP60710 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ActbP60710 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ActbP60710 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ActbP60710 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ActbP60710 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ActbP60710 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ActbP60710 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ActbP60710 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ActbP60710 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ActbP60710 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ActbP60710 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ActbP60710 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ActbP60710 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ActbP60710 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ActbP60710 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ActbP60710 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ActbP60710 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ActbP60710 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ActbP60710 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ActbP60710 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ActbP60710 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ActbP60710 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ActbP60710 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ActbP60710 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ActbP60710 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ActbP60710 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ActbP60710 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ActbP60710 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ActbP60710 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ActbP60710 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ActbP60710 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ActbP60710 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ActbP60710 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ActbP60710 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ActbP60710 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ActbP60710 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ActbP60710 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ActbP60710 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ActbP60710 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ActbP60710 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ActbP60710 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ActbP60710 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ActbP60710 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ActbP60710 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ActbP60710 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ActbP60710 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ActbP60710 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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