Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ppfia3P60469 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms