Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarf2P59222 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms