Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Csrnp1P59054 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Csrnp1P59054 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Csrnp1P59054 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Csrnp1P59054 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Csrnp1P59054 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrnp1P59054 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms