Protein–RNA interactions for Protein: P58462

Foxp1, Forkhead box protein P1, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp1P58462 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Foxp1P58462 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxp1P58462 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxp1P58462 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxp1P58462 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxp1P58462 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxp1P58462 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxp1P58462 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxp1P58462 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxp1P58462 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxp1P58462 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxp1P58462 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxp1P58462 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxp1P58462 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxp1P58462 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxp1P58462 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxp1P58462 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxp1P58462 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxp1P58462 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxp1P58462 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxp1P58462 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxp1P58462 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Foxp1P58462 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms