Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samsn1P57725 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms