Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn18P56857 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn18P56857 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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