Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TdgP56581 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TdgP56581 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TdgP56581 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TdgP56581 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TdgP56581 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TdgP56581 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TdgP56581 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TdgP56581 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TdgP56581 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TdgP56581 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TdgP56581 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TdgP56581 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TdgP56581 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TdgP56581 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TdgP56581 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TdgP56581 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TdgP56581 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TdgP56581 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TdgP56581 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TdgP56581 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TdgP56581 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TdgP56581 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TdgP56581 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TdgP56581 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TdgP56581 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TdgP56581 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TdgP56581 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TdgP56581 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TdgP56581 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TdgP56581 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TdgP56581 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TdgP56581 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TdgP56581 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TdgP56581 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TdgP56581 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TdgP56581 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TdgP56581 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TdgP56581 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TdgP56581 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TdgP56581 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TdgP56581 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TdgP56581 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TdgP56581 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TdgP56581 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TdgP56581 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TdgP56581 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TdgP56581 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TdgP56581 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TdgP56581 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TdgP56581 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TdgP56581 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TdgP56581 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TdgP56581 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TdgP56581 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TdgP56581 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TdgP56581 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TdgP56581 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TdgP56581 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TdgP56581 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TdgP56581 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TdgP56581 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TdgP56581 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TdgP56581 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TdgP56581 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TdgP56581 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TdgP56581 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TdgP56581 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TdgP56581 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TdgP56581 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TdgP56581 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TdgP56581 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TdgP56581 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TdgP56581 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TdgP56581 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TdgP56581 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TdgP56581 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TdgP56581 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TdgP56581 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TdgP56581 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TdgP56581 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TdgP56581 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TdgP56581 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TdgP56581 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TdgP56581 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TdgP56581 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TdgP56581 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TdgP56581 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TdgP56581 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TdgP56581 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TdgP56581 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TdgP56581 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TdgP56581 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TdgP56581 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TdgP56581 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TdgP56581 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TdgP56581 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TdgP56581 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TdgP56581 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TdgP56581 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms