Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GemP55041 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GemP55041 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GemP55041 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GemP55041 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GemP55041 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GemP55041 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GemP55041 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GemP55041 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GemP55041 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GemP55041 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GemP55041 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GemP55041 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GemP55041 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GemP55041 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GemP55041 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GemP55041 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GemP55041 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GemP55041 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GemP55041 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GemP55041 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GemP55041 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GemP55041 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GemP55041 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GemP55041 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GemP55041 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GemP55041 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GemP55041 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GemP55041 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GemP55041 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GemP55041 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GemP55041 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GemP55041 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GemP55041 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GemP55041 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GemP55041 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GemP55041 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GemP55041 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GemP55041 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GemP55041 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GemP55041 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GemP55041 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GemP55041 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GemP55041 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GemP55041 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GemP55041 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GemP55041 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GemP55041 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GemP55041 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GemP55041 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GemP55041 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GemP55041 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GemP55041 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GemP55041 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GemP55041 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GemP55041 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GemP55041 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GemP55041 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GemP55041 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GemP55041 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GemP55041 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GemP55041 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GemP55041 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GemP55041 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GemP55041 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GemP55041 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GemP55041 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GemP55041 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GemP55041 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GemP55041 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GemP55041 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GemP55041 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GemP55041 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GemP55041 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GemP55041 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GemP55041 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GemP55041 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GemP55041 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GemP55041 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GemP55041 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GemP55041 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GemP55041 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GemP55041 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GemP55041 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GemP55041 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GemP55041 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GemP55041 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GemP55041 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GemP55041 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GemP55041 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GemP55041 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GemP55041 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GemP55041 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GemP55041 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GemP55041 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GemP55041 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GemP55041 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GemP55041 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GemP55041 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GemP55041 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms