Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NrlP54846 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NrlP54846 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NrlP54846 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NrlP54846 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NrlP54846 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NrlP54846 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NrlP54846 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NrlP54846 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NrlP54846 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NrlP54846 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NrlP54846 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NrlP54846 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NrlP54846 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NrlP54846 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NrlP54846 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NrlP54846 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NrlP54846 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NrlP54846 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NrlP54846 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NrlP54846 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NrlP54846 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NrlP54846 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NrlP54846 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NrlP54846 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NrlP54846 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NrlP54846 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NrlP54846 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NrlP54846 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NrlP54846 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NrlP54846 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NrlP54846 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NrlP54846 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NrlP54846 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NrlP54846 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NrlP54846 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NrlP54846 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NrlP54846 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NrlP54846 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NrlP54846 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NrlP54846 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NrlP54846 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NrlP54846 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NrlP54846 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NrlP54846 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NrlP54846 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NrlP54846 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NrlP54846 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NrlP54846 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NrlP54846 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NrlP54846 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NrlP54846 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NrlP54846 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NrlP54846 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NrlP54846 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NrlP54846 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NrlP54846 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NrlP54846 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NrlP54846 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NrlP54846 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NrlP54846 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NrlP54846 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NrlP54846 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NrlP54846 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NrlP54846 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NrlP54846 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NrlP54846 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NrlP54846 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NrlP54846 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NrlP54846 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NrlP54846 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NrlP54846 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NrlP54846 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NrlP54846 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NrlP54846 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NrlP54846 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NrlP54846 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NrlP54846 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NrlP54846 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NrlP54846 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NrlP54846 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NrlP54846 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NrlP54846 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NrlP54846 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NrlP54846 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NrlP54846 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NrlP54846 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NrlP54846 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NrlP54846 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NrlP54846 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NrlP54846 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NrlP54846 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NrlP54846 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NrlP54846 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NrlP54846 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NrlP54846 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NrlP54846 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NrlP54846 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NrlP54846 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NrlP54846 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms