Protein–RNA interactions for Protein: P53996

Cnbp, Cellular nucleic acid-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnbpP53996 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC10□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CnbpP53996 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CnbpP53996 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CnbpP53996 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC10□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC10□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CnbpP53996 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CnbpP53996 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CnbpP53996 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CnbpP53996 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CnbpP53996 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CnbpP53996 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CnbpP53996 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms