Protein–RNA interactions for Protein: P50586

Tub, Tubby protein, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TubP50586 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TubP50586 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TubP50586 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TubP50586 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TubP50586 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TubP50586 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TubP50586 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TubP50586 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TubP50586 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TubP50586 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TubP50586 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TubP50586 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TubP50586 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TubP50586 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TubP50586 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TubP50586 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TubP50586 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TubP50586 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TubP50586 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TubP50586 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TubP50586 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TubP50586 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TubP50586 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TubP50586 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TubP50586 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TubP50586 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TubP50586 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TubP50586 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TubP50586 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TubP50586 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TubP50586 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TubP50586 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TubP50586 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TubP50586 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TubP50586 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TubP50586 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TubP50586 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TubP50586 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TubP50586 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TubP50586 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TubP50586 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TubP50586 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TubP50586 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TubP50586 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TubP50586 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TubP50586 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TubP50586 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TubP50586 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TubP50586 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TubP50586 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TubP50586 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TubP50586 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TubP50586 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TubP50586 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TubP50586 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TubP50586 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TubP50586 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TubP50586 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TubP50586 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TubP50586 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TubP50586 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TubP50586 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TubP50586 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TubP50586 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TubP50586 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TubP50586 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TubP50586 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TubP50586 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TubP50586 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TubP50586 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TubP50586 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TubP50586 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TubP50586 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TubP50586 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TubP50586 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TubP50586 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TubP50586 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TubP50586 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TubP50586 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TubP50586 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TubP50586 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TubP50586 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TubP50586 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TubP50586 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TubP50586 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TubP50586 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TubP50586 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TubP50586 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TubP50586 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TubP50586 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TubP50586 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TubP50586 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TubP50586 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TubP50586 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TubP50586 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TubP50586 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TubP50586 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TubP50586 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TubP50586 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TubP50586 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms