Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rbp3P49194 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbp3P49194 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms