Protein–RNA interactions for Protein: P43247

Msh2, DNA mismatch repair protein Msh2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh2P43247 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh2P43247 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh2P43247 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh2P43247 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh2P43247 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh2P43247 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh2P43247 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh2P43247 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms