Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtgfrP43117 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms