Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gdf5P43027 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf5P43027 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf5P43027 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf5P43027 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gdf5P43027 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf5P43027 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf5P43027 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gdf5P43027 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gdf5P43027 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gdf5P43027 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf5P43027 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf5P43027 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf5P43027 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf5P43027 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf5P43027 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf5P43027 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf5P43027 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf5P43027 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf5P43027 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf5P43027 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf5P43027 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf5P43027 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf5P43027 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf5P43027 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf5P43027 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf5P43027 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gdf5P43027 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf5P43027 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf5P43027 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf5P43027 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf5P43027 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf5P43027 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf5P43027 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf5P43027 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf5P43027 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf5P43027 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf5P43027 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf5P43027 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf5P43027 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf5P43027 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf5P43027 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf5P43027 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gdf5P43027 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gdf5P43027 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf5P43027 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf5P43027 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gdf5P43027 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf5P43027 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf5P43027 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf5P43027 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf5P43027 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf5P43027 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf5P43027 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf5P43027 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf5P43027 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf5P43027 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf5P43027 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf5P43027 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf5P43027 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf5P43027 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf5P43027 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf5P43027 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf5P43027 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms