Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ddit3P35639 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddit3P35639 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms