Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab20P35295 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab20P35295 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab20P35295 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab20P35295 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab20P35295 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab20P35295 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab20P35295 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab20P35295 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab20P35295 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab20P35295 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab20P35295 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab20P35295 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab20P35295 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab20P35295 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms