Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nedd1P33215 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms