Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxc10P31257 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxc10P31257 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms