Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Gm21118-202ENSMUST00000187418 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Gm35216-201ENSMUST00000203777 433 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Ifnb1-201ENSMUST00000055671 750 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Gm37440-202ENSMUST00000195572 1227 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa2P31245 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms