Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RxrgP28705 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
RxrgP28705 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RxrgP28705 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RxrgP28705 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RxrgP28705 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RxrgP28705 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RxrgP28705 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RxrgP28705 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RxrgP28705 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RxrgP28705 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RxrgP28705 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RxrgP28705 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RxrgP28705 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RxrgP28705 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RxrgP28705 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RxrgP28705 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RxrgP28705 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RxrgP28705 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RxrgP28705 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RxrgP28705 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RxrgP28705 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RxrgP28705 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RxrgP28705 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RxrgP28705 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RxrgP28705 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RxrgP28705 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RxrgP28705 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RxrgP28705 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RxrgP28705 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RxrgP28705 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RxrgP28705 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RxrgP28705 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RxrgP28705 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RxrgP28705 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RxrgP28705 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RxrgP28705 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RxrgP28705 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RxrgP28705 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RxrgP28705 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RxrgP28705 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RxrgP28705 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RxrgP28705 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RxrgP28705 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RxrgP28705 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RxrgP28705 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RxrgP28705 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RxrgP28705 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RxrgP28705 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RxrgP28705 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RxrgP28705 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RxrgP28705 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RxrgP28705 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RxrgP28705 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RxrgP28705 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RxrgP28705 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RxrgP28705 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RxrgP28705 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RxrgP28705 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RxrgP28705 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RxrgP28705 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RxrgP28705 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RxrgP28705 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RxrgP28705 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RxrgP28705 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RxrgP28705 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RxrgP28705 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RxrgP28705 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RxrgP28705 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RxrgP28705 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RxrgP28705 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RxrgP28705 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RxrgP28705 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RxrgP28705 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RxrgP28705 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RxrgP28705 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RxrgP28705 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RxrgP28705 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RxrgP28705 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RxrgP28705 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RxrgP28705 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
RxrgP28705 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RxrgP28705 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RxrgP28705 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RxrgP28705 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RxrgP28705 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
RxrgP28705 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RxrgP28705 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RxrgP28705 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RxrgP28705 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RxrgP28705 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RxrgP28705 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RxrgP28705 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RxrgP28705 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
RxrgP28705 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RxrgP28705 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RxrgP28705 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RxrgP28705 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RxrgP28705 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RxrgP28705 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms