Protein–RNA interactions for Protein: P28660

Nckap1, Nck-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap1P28660 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nckap1P28660 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nckap1P28660 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nckap1P28660 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nckap1P28660 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nckap1P28660 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nckap1P28660 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nckap1P28660 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nckap1P28660 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nckap1P28660 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nckap1P28660 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nckap1P28660 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nckap1P28660 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nckap1P28660 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nckap1P28660 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nckap1P28660 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nckap1P28660 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nckap1P28660 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nckap1P28660 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nckap1P28660 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nckap1P28660 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nckap1P28660 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nckap1P28660 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nckap1P28660 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nckap1P28660 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nckap1P28660 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nckap1P28660 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nckap1P28660 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nckap1P28660 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nckap1P28660 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nckap1P28660 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nckap1P28660 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nckap1P28660 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nckap1P28660 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nckap1P28660 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nckap1P28660 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nckap1P28660 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nckap1P28660 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nckap1P28660 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nckap1P28660 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nckap1P28660 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nckap1P28660 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nckap1P28660 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nckap1P28660 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nckap1P28660 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Nckap1P28660 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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