Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LoxP28301 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LoxP28301 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LoxP28301 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LoxP28301 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LoxP28301 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LoxP28301 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LoxP28301 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LoxP28301 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
LoxP28301 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
LoxP28301 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LoxP28301 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LoxP28301 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
LoxP28301 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LoxP28301 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LoxP28301 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LoxP28301 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LoxP28301 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LoxP28301 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LoxP28301 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LoxP28301 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LoxP28301 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LoxP28301 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LoxP28301 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LoxP28301 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LoxP28301 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LoxP28301 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LoxP28301 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LoxP28301 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
LoxP28301 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LoxP28301 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LoxP28301 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LoxP28301 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LoxP28301 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
LoxP28301 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LoxP28301 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LoxP28301 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
LoxP28301 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
LoxP28301 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
LoxP28301 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LoxP28301 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LoxP28301 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LoxP28301 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LoxP28301 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LoxP28301 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LoxP28301 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LoxP28301 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LoxP28301 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LoxP28301 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LoxP28301 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LoxP28301 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LoxP28301 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LoxP28301 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LoxP28301 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LoxP28301 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
LoxP28301 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LoxP28301 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LoxP28301 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LoxP28301 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LoxP28301 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LoxP28301 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LoxP28301 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LoxP28301 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LoxP28301 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LoxP28301 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LoxP28301 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LoxP28301 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LoxP28301 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LoxP28301 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LoxP28301 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LoxP28301 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
LoxP28301 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LoxP28301 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LoxP28301 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LoxP28301 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LoxP28301 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LoxP28301 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LoxP28301 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LoxP28301 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LoxP28301 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LoxP28301 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
LoxP28301 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
LoxP28301 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
LoxP28301 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
LoxP28301 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LoxP28301 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LoxP28301 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LoxP28301 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LoxP28301 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LoxP28301 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LoxP28301 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LoxP28301 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LoxP28301 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LoxP28301 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LoxP28301 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LoxP28301 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LoxP28301 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LoxP28301 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LoxP28301 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LoxP28301 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms