Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb1P28230 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms