Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjc1P28229 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms