Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Psmb9P28076 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms