Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnna1P26231 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctnna1P26231 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms