Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja1P23242 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja1P23242 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja1P23242 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja1P23242 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja1P23242 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gja1P23242 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms