Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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SftpcP21841 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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SftpcP21841 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpcP21841 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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SftpcP21841 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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SftpcP21841 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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SftpcP21841 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
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SftpcP21841 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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SftpcP21841 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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