Protein–RNA interactions for Protein: P20029

Hspa5, 78 kDa glucose-regulated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspa5P20029 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hspa5P20029 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hspa5P20029 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hspa5P20029 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Hspa5P20029 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Hspa5P20029 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hspa5P20029 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Hspa5P20029 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hspa5P20029 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hspa5P20029 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hspa5P20029 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hspa5P20029 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hspa5P20029 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hspa5P20029 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hspa5P20029 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hspa5P20029 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hspa5P20029 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hspa5P20029 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hspa5P20029 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hspa5P20029 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hspa5P20029 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hspa5P20029 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Hspa5P20029 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hspa5P20029 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hspa5P20029 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hspa5P20029 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hspa5P20029 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hspa5P20029 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hspa5P20029 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Hspa5P20029 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Hspa5P20029 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Hspa5P20029 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hspa5P20029 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hspa5P20029 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hspa5P20029 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hspa5P20029 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Hspa5P20029 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hspa5P20029 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hspa5P20029 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Hspa5P20029 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hspa5P20029 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hspa5P20029 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hspa5P20029 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hspa5P20029 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hspa5P20029 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hspa5P20029 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hspa5P20029 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Hspa5P20029 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hspa5P20029 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hspa5P20029 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Hspa5P20029 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hspa5P20029 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hspa5P20029 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Hspa5P20029 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hspa5P20029 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hspa5P20029 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Hspa5P20029 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Hspa5P20029 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hspa5P20029 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hspa5P20029 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hspa5P20029 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hspa5P20029 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hspa5P20029 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hspa5P20029 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hspa5P20029 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hspa5P20029 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hspa5P20029 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hspa5P20029 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hspa5P20029 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hspa5P20029 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hspa5P20029 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hspa5P20029 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hspa5P20029 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hspa5P20029 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Hspa5P20029 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hspa5P20029 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hspa5P20029 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hspa5P20029 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hspa5P20029 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hspa5P20029 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hspa5P20029 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Hspa5P20029 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hspa5P20029 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hspa5P20029 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hspa5P20029 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hspa5P20029 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hspa5P20029 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hspa5P20029 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hspa5P20029 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hspa5P20029 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Hspa5P20029 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Hspa5P20029 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hspa5P20029 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hspa5P20029 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Hspa5P20029 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hspa5P20029 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hspa5P20029 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hspa5P20029 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hspa5P20029 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hspa5P20029 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms