Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Hoxb1P17919 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Hoxb1P17919 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxb1P17919 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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