Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sptan1P16546 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sptan1P16546 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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