Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrphP15331 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrphP15331 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrphP15331 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrphP15331 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrphP15331 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PrphP15331 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrphP15331 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrphP15331 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PrphP15331 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrphP15331 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PrphP15331 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrphP15331 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrphP15331 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PrphP15331 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrphP15331 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrphP15331 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrphP15331 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrphP15331 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrphP15331 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrphP15331 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrphP15331 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrphP15331 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PrphP15331 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrphP15331 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrphP15331 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrphP15331 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrphP15331 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrphP15331 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrphP15331 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrphP15331 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrphP15331 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PrphP15331 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrphP15331 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PrphP15331 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrphP15331 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrphP15331 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrphP15331 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrphP15331 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PrphP15331 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrphP15331 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrphP15331 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrphP15331 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrphP15331 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrphP15331 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrphP15331 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrphP15331 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrphP15331 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrphP15331 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrphP15331 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrphP15331 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrphP15331 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PrphP15331 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrphP15331 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrphP15331 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrphP15331 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrphP15331 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PrphP15331 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PrphP15331 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PrphP15331 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PrphP15331 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PrphP15331 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PrphP15331 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PrphP15331 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PrphP15331 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PrphP15331 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrphP15331 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrphP15331 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrphP15331 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrphP15331 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrphP15331 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrphP15331 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrphP15331 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PrphP15331 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrphP15331 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrphP15331 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrphP15331 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrphP15331 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PrphP15331 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrphP15331 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrphP15331 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PrphP15331 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrphP15331 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrphP15331 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrphP15331 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrphP15331 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrphP15331 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrphP15331 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrphP15331 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrphP15331 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrphP15331 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PrphP15331 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrphP15331 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrphP15331 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrphP15331 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrphP15331 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrphP15331 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrphP15331 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrphP15331 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrphP15331 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms