Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms