Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
P10404 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
P10404 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
P10404 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
P10404 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
P10404 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
P10404 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
P10404 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
P10404 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
P10404 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
P10404 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
P10404 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
P10404 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
P10404 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
P10404 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
P10404 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
P10404 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
P10404 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
P10404 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
P10404 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
P10404 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
P10404 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
P10404 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
P10404 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
P10404 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
P10404 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
P10404 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
P10404 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
P10404 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
P10404 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
P10404 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
P10404 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
P10404 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
P10404 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
P10404 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
P10404 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
P10404 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
P10404 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
P10404 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
P10404 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
P10404 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
P10404 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
P10404 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
P10404 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
P10404 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
P10404 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
P10404 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
P10404 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
P10404 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
P10404 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
P10404 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
P10404 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
P10404 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
P10404 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
P10404 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
P10404 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
P10404 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
P10404 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P10404 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P10404 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P10404 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P10404 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P10404 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P10404 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
P10404 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P10404 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P10404 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
P10404 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P10404 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P10404 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
P10404 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P10404 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
P10404 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P10404 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
P10404 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
P10404 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P10404 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
P10404 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
P10404 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P10404 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
P10404 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P10404 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
P10404 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
P10404 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P10404 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P10404 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P10404 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
P10404 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P10404 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P10404 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P10404 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
P10404 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
P10404 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
P10404 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
P10404 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
P10404 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
P10404 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
P10404 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
P10404 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
P10404 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
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