Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms