Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc8P09025 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms