Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxa5P09021 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms