Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtrP07309 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
TtrP07309 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtrP07309 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtrP07309 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtrP07309 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtrP07309 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtrP07309 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtrP07309 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtrP07309 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtrP07309 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtrP07309 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtrP07309 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtrP07309 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtrP07309 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtrP07309 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtrP07309 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtrP07309 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtrP07309 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TtrP07309 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtrP07309 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtrP07309 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtrP07309 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtrP07309 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtrP07309 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtrP07309 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtrP07309 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtrP07309 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtrP07309 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtrP07309 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtrP07309 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtrP07309 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtrP07309 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtrP07309 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtrP07309 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtrP07309 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtrP07309 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtrP07309 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtrP07309 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtrP07309 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
TtrP07309 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtrP07309 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
TtrP07309 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtrP07309 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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TtrP07309 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtrP07309 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtrP07309 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtrP07309 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtrP07309 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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TtrP07309 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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TtrP07309 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtrP07309 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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TtrP07309 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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TtrP07309 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtrP07309 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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TtrP07309 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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TtrP07309 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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TtrP07309 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtrP07309 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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TtrP07309 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtrP07309 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtrP07309 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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TtrP07309 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtrP07309 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtrP07309 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtrP07309 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtrP07309 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtrP07309 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtrP07309 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtrP07309 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtrP07309 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtrP07309 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtrP07309 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtrP07309 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtrP07309 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtrP07309 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtrP07309 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtrP07309 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtrP07309 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtrP07309 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtrP07309 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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