Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04214 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04214 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04214 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04214 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04214 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04214 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04214 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04214 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04214 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04214 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04214 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P04214 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04214 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04214 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04214 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04214 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04214 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04214 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04214 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04214 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04214 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04214 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04214 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04214 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04214 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04214 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04214 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04214 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04214 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04214 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P04214 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P04214 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04214 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04214 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04214 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04214 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P04214 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04214 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04214 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04214 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04214 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04214 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04214 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04214 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04214 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04214 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04214 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04214 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P04214 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04214 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04214 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04214 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04214 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04214 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04214 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04214 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04214 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P04214 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04214 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P04214 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P04214 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P04214 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04214 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04214 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P04214 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P04214 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04214 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04214 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P04214 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04214 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P04214 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04214 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04214 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04214 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04214 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04214 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04214 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P04214 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04214 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04214 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04214 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04214 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04214 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04214 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04214 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04214 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04214 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04214 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04214 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P04214 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04214 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04214 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04214 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04214 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04214 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04214 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04214 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04214 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P04214 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms