Protein–RNA interactions for Protein: P02340

Tp53, Cellular tumor antigen p53, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53P02340 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tp53P02340 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tp53P02340 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tp53P02340 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tp53P02340 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tp53P02340 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tp53P02340 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tp53P02340 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tp53P02340 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tp53P02340 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tp53P02340 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tp53P02340 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tp53P02340 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tp53P02340 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tp53P02340 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tp53P02340 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tp53P02340 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tp53P02340 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tp53P02340 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tp53P02340 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tp53P02340 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tp53P02340 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tp53P02340 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tp53P02340 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tp53P02340 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tp53P02340 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53P02340 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53P02340 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53P02340 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53P02340 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53P02340 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53P02340 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53P02340 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53P02340 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53P02340 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53P02340 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53P02340 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53P02340 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53P02340 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53P02340 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53P02340 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53P02340 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53P02340 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53P02340 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53P02340 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53P02340 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53P02340 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53P02340 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53P02340 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53P02340 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53P02340 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53P02340 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53P02340 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53P02340 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tp53P02340 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tp53P02340 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tp53P02340 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53P02340 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53P02340 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53P02340 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tp53P02340 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms